临床医学院是学校办学历史最悠久的二级学院之一，前身为保山中医药高等专科学校临床医学系，2020年4月挂牌成立临床医学院，下设内科、外科、妇儿、综合、预防五个教研室，开设临床医学、预防医学、康复治疗技术、医学影像技术、口腔医学技术等5个三年制专科专业和康复治疗技术、医学影像技术2个五年制专科专业。

学院遵循“基础理论适度、技术应用能力强、知识面宽、综合素质高”的办学特点，以“服务为宗旨、就业为导向、岗位为前提、能力为重点、素质为根本”的办学理念，为社会培养了大批高素质、实用型医学专门人才。拥有一支结构合理、素质良好、敬业爱岗、专兼结合、富有活力的优秀教师队伍。现有专任教师42人，其中，昆明医科大学博士生导师、硕士生导师1人，国务院、省政府特殊津贴专家1人，云岭教学名师1人，省级高校教学名师2人，校级教学名师3人；教授4人，副教授12人；在读博士1人，硕士研究生学历教师18人，有名师工作室1个，《诊断学》为省级精品课程，内科教研室为省级优秀教学团队。

临床医学院弘扬“博极医源、精勤不倦”的大医精诚精神，秉承“以德载术，博学精业”的院训，牢记“健康所系，性命相托”的医学生誓言、坚持“以生为本”的办学宗旨，紧紧围绕“立德树人”的根本任务，做好课程思政，素质教育与专业教育紧密结合，坚持对学生进行思想政治教育、学业导航教育、成长教育，注重专业能力、医学生综合素质的综合培养，服务学生全面成长，着力完善“三全育人”工作格局和推进“十大育人体系”的构建。