临床医学院是学校办学历史最悠久的二级学院之一，下设内科、外科、妇儿、综合四个教研室，开设临床医学、康复治疗技术、医学影像技术、口腔医学技术等4个三年制专科专业和康复治疗技术、医学影像技术2个五年制专科专业，康复治疗技术专业与云南中医药大学达成高本贯通合作项目。临床医学院是国家首批急救试点单位、教育部第二期、第四期育人就业基地、国家执业医师实践技能考试（临床类别）基地、临床技能实训中心为中央财政支持和云南省教育厅支持的职业教育实训基地建设项目；临床医学专业教学团队获批云南省第一批教师教学创新团队，临床医学专业为云南省高等职业教育高水平骨干专业；康复治疗技术专业、口腔技术专业为省级学徒制试点专业，已经成功通过省教育厅验收，《诊断学》为省级精品课程，《诊断学》被评为“十四五”国家规划教材，内科教研室为省级优秀教学团队，有省级名师工作室1个，校级教学创新团队2个。

学院遵循“基础理论适度、技术应用能力强、知识面宽、综合素质高”的办学特点，“以服务为宗旨、就业为导向、岗位为前提、能力为重点、素质为根本”的办学理念，为社会培养了大批高素质、实用型医学专门人才。拥有一支结构合理、素质良好、敬业爱岗、专兼结合、富有活力的优秀教师队伍。现有专任教师40人，其中，2023年“兴滇英才支持计划”教育人才1人，省级高校教学名师4人，永昌教学名师1人，校级教学名师3人；教授2人，副教授14人；硕士研究生学历教师15人，云南省高校最美辅导员2人，云南省最美班主任1人。云南省职业教育“双师型”教师30人。

临床医学院弘扬 “博极医源，精勤不倦”的大医精诚精神，秉承“以德载术，博学精业”的院训，牢记“健康所系，性命相托”的医学生誓言、坚持“以生为本”的办学宗旨，紧紧围绕“立德树人”的根本任务，做好课程思政，素质教育与专业教育紧密结合，坚持对学生进行思想政治教育、学业导航教育、成长教育，注重专业能力、医学生综合素质的综合培养，服务学生全面成长，着力完善“三全育人”工作格局和推进“十大育人体系”的构建。

近年来，学院以“双高”建设为契机，着力培养“下得去，留得住，用得上，用得好”的医药卫生人才，得到了用人单位和社会的广泛认可，毕业生深受各级医疗卫生单位青睐。学院高度重视人才培养质量，近年在各类大赛中获得多项殊荣：2025年云南省国际大学生创新大赛金奖1项、银奖2项；第十二届“泰山杯”医学影像技术专业大学生实践技能大赛二等奖4项、三等奖2项、团队二等奖；2025年“一带一路”暨国家技能发展与技术创新大赛获二等奖1项、三等奖1项、优秀组织奖；2025年云南省职业院校技能大赛（高职组）团队三等奖4项；内科学教学团队获省级教学比赛二等级。